En 1954, dans le désert du Nouveau-Mexique, où a explosé la première bombe atomique. Une petite fille de 6 ans est retrouvée seule, visiblement en état de choc. Elle a vu quelque chose, mais semble incapable de parler. Le sergent Ben Peterson mène l'enquête. A l'intérieur d'une caravane abandonnée et saccagée, il découvre le cadavre d'un homme, sauvagement assassiné, ainsi que de mystérieuses empreintes qu'il ne parvient pas à identifier. Le FBI s'intéresse bientôt à ce drame aux ressorts mystérieux. Le médecin qui a examiné les victimes entrevoit une première explication qu'il a lui-même du mal à croire. C'est alors qu'une gigantesque fourmi apparaît...